W feudalnej Japonii chciwy daimyo oddaje 48 części ciała swojego nowo narodzonego syna demonom w zamian za władzę. Chłopiec - pozbawiony oczu, skóry i kończyn - zostaje porzucony, lecz przeżywa dzięki pomocy pewnego znachora. Gdy dorasta jako bezimienny wojownik z protezami, spotyka młodego złodziejaszka Dororo i razem wyruszają w podróż, by odzyskać to, co zostało mu skradzione.